Bioinformática
Bioinformática é a área onde profissionais com conhecimentos biológicos como biologia molecular buscam desenvolver softwares
para análises de dados obtidos por diferentes tipos de tecnologia.
Um exemplo desses softwares é o Blast
que compara sequências de nucletídeos e/ou aminoácidos e informa as regiões de semelhança.
PET Computação
O PET Computação da UFPR é o Programa de Educação Tutorial relacionado aos cursos
Informática Biomédica e Ciencia da Computação. No programa busca-se a participação de seus membros em projetos de
pesquisa, ensino e extensão gerenciados pelos alunos e o tutor do grupo que deve ser um docente do departamento relacionado ao
PET.
O programa oferece a oportunidade da construção pessoal, profissional e de conhecimento tanto dos petianos quanto do tutor. No
início de cada ano, há um planejamento de que projetos o grupo irá executar ao longo do ano.
Dentro do PET pode haver tanto alunos bolsistas como voluntários porém, isso não distingue o nível de comprometimento entre eles.
Compressão de dados biológicos
Compressão de dados biológicos é uma área de grande importância para grandes projetos como o projeto
100,000 Genomes Project.
Assim como compressão de vídeos, diversas técnicas podem ser utilizadas para melhorar o resultado das compressões
de sequências de DNA ou proteínas devido à especificidade do problema. O artigo
Data compression for sequencing data
traz comparações entre algorítmos, softwares e bibliotecas já existentes para soluções desse problema.
Um dos principais problemas encontrados é a ponderação entre velocidade de compressão/descompressão dos dados e
seu ratio. Os algoritmos são usados por diferentes motivos, um deles é para a melhor performace de banco de dados
biológicos, outro é a redução do custo de tráfego ao transferir as sequências entre diferentes computadores ou até mesmo
em tempo de execução de um programa para transferência do disco rígido para memória principal.
Uma abordagem da área com mais detalhes pode ser vista no estudo
Textual data compression in computational biology: a synopsis.
